비교
bedGraph와 bigWig: 수치 텍스트와 색인 배포 비교
bedGraph는 구간·값 텍스트, bigWig는 색인된 수치 트랙입니다.
어떤 형식을 선택해야 할까요?
확인·가공에는 bedGraph, 대형 원격 구간 접근에는 bigWig를 검토합니다.
적합한 경우 bedGraph
유전체 신호 트랙 전달
- 가변 길이 구간의 수치 확인·처리
적합한 경우 bigWig
대형 유전체 신호 배포
- 지정 구간의 값 읽기
기본 정보
| 항목 | bedGraph | bigWig |
|---|---|---|
| 확장자 | .bedGraph | .bw, .bigWig |
| MIME 유형 | ||
| 주요 용도 | 유전체 신호 트랙 전달 | 대형 유전체 신호 배포 |
| 여는 방법 | 지원 도구로 참조 버전·이름·좌표·값을 확인합니다. 사용자 트랙의 track/browser 행과 분석 데이터 행을 구분하고 헤더 지원을 확인합니다. | bigWig 도구로 참조명·범위·값을 확인합니다. 요약과 원래 구간값을 구분하고 실제 호스팅에서 원격 접근·부분 읽기를 검증합니다. |
| 내보내기 또는 변환 | bigWig에는 한 트랙을 정렬하고 염색체 내 비중첩 구간과 맞는 chrom.sizes를 준비합니다. 표시 헤더를 빼고 변환 후 위치·값·범위를 대조합니다. | bedGraphToBigWig에는 정렬된 비중첩 구간과 맞는 chrom.sizes가 필요합니다. 표시 헤더를 빼고 좌표·기록 구간·값을 대조하며 수정 후 원본에서 재생성합니다. |
용도별 선택
가변 길이 구간의 수치 확인·처리
유전체 신호 트랙 전달
bedGraph지정 구간의 값 읽기
대형 유전체 신호 배포
bigWig핵심 사항 1
bedGraph는 염색체·시작·끝·값의 4열입니다.
차이 자세히 보기핵심 사항 2
bigWig 도구는 구간 데이터나 요약을 읽습니다.
차이 자세히 보기차이 자세히 보기
참조 버전·단위·정규화·결측 의미·정밀도를 합의합니다. 크기·속도뿐 아니라 읽기 API와 호스팅도 확인합니다.
- bedGraphToBigWig에는 한 트랙을 정렬하고 겹침을 해결하며 chrom.sizes를 맞추고 표시 헤더를 제거합니다. bedGraph 구간의 시작을 1만큼 옮기지 않습니다.
- bigWig 단정밀도로 반올림될 수 있어 허용오차를 정합니다. 미기록과 0, 요약 평균과 원래 값을 구분하고 내보내기를 검증합니다.
자주 묻는 질문
변환 후 원본 텍스트를 버려도 되나요?
아니요. 십진 표기나 표시 설정의 완전 복원은 보장되지 않습니다. 원본·참조 정보·생성 조건을 보관합니다.