कार्य चरण के अनुसार सीक्वेंसिंग फ़ाइल चुनना

FASTQ अनुक्रम, गुणवत्ता एन्कोडिंग, paired-end का मेल और रीड संख्या जाँचें। संरेखण को संदर्भ और सेटिंग चाहिए। मौजूदा संरेखण का रूप बदलना और रीड को संदर्भ पर दोबारा मैप करना अलग प्रक्रियाएँ हैं।

SAM में हेडर और टैग जाँचें, फिर संगत उपकरण से BAM या CRAM रखें। क्षेत्रवार खोज के लिए निर्देशांक क्रम और आवश्यक BAI/CSI/CRAI इंडेक्स बनाएँ। CRAM संदर्भ प्राप्ति या समावेशन तथा गुणवत्ता/टैग संरक्षण दर्ज करें और पहले-बाद के डेटा मिलाएँ।

डेटा, इंडेक्स, संदर्भ पहचान, संस्करण, सेटिंग, संरक्षण नीति और चेकसम दें। प्राप्तकर्ता के रीडर में जाँचें और पहुँच व रखने की अवधि तय करें। रिपॉज़िटरी के प्रारूप और मेटाडेटा नियम अलग जाँचें।