गाइड
जीनोम एनोटेशन और संख्यात्मक ट्रैक सौंपने की प्रक्रिया
एनोटेशन को संख्यात्मक संकेतों से अलग रखें और संदर्भ जीनोम, निर्देशांक, इकाइयों व व्यूअर पर सहमति बनाएं। यह मूल रीड या अलाइनमेंट सुरक्षित रखने से अलग चरण है।
कौन-सा फ़ॉर्मैट चुनें?
अपने कार्यप्रवाह में हर फ़ाइल की भूमिका के अनुसार चुनें।
- अर्थ और संदर्भ तय करें
- प्रदर्शन प्रतियों की जांच करें
- प्राप्तकर्ता के परिवेश में परखें
अर्थ और संदर्भ तय करें
असेंबली संस्करण, क्रोमोसोम नाम और निर्देशांक नियम दर्ज करें। शून्य से शुरू होने वाले, अंतिम बिंदु को बाहर रखने वाले BED अंतरालों को दूसरे नियमों से न मिलाएं। इकाइयां, सामान्यीकरण और अनुपस्थित मान व शून्य का अंतर स्पष्ट करें।
प्रदर्शन प्रतियों की जांच करें
आवश्यकतानुसार BED एनोटेशन को bigBed या bedGraph संकेतों को bigWig में बदलें। क्रम, क्रोमोसोम लंबाई और अतिरिक्त कॉलम की परिभाषाएं जांचें। प्रतिनिधि अंतराल व मान स्रोत से मिलाएं; bigWig की एकल-परिशुद्धता राउंडिंग और प्रदर्शन सारांश भी जांचें।
प्राप्तकर्ता के परिवेश में परखें
फ़ाइलें, रूपांतरण सेटिंग, चेकसम और प्रदर्शन सेटिंग दें। प्राप्तकर्ता के व्यूअर में वही संदर्भ और अंतराल खोलें। Track Hub के लिए कॉन्फ़िगरेशन और होस्टिंग भी जांचें।
उपयुक्त फ़ॉर्मैट
निर्यात से पहले जाँचें
- सूची में न दिखने वाला Hub भी URL जानने वाले को उपलब्ध हो सकता है। URL छिपाना पहुंच नियंत्रण नहीं है; संवेदनशील डेटा के लिए स्वीकृत परिवेश इस्तेमाल करें।
- मूल डेटा रखें। समान प्रदर्शन या चेकसम विश्लेषण की शुद्धता सिद्ध नहीं करते; प्रदर्शन सारांश मूल अंतराल मानों के समान नहीं होते।