Format Atlas

أدلة

تسليم تعليقات الجينوم ومسارات الإشارة

افصل التعليقات عن الإشارات العددية واتفق على المرجع والإحداثيات والوحدات وأداة العرض. تختلف هذه الخطوة عن حفظ القراءات أو نتائج المحاذاة.

أي تنسيق يجب أن تختار؟

اختر وفق دور كل ملف في سير عملك.

  • تحديد المعنى والمرجع
  • التحقق من نسخ العرض
  • الاختبار في بيئة المستلم

تحديد المعنى والمرجع

سجّل إصدار التجميع وأسماء الكروموسومات ونظام الإحداثيات. لا تخلط فترات BED التي تبدأ من الصفر وتستثني النهاية مع الأنظمة الأخرى. وضّح الوحدات والتطبيع والفرق بين القيم المفقودة والصفر.

التحقق من نسخ العرض

حوّل تعليقات BED إلى bigBed أو إشارات bedGraph إلى bigWig حسب الحاجة. افحص الترتيب وأطوال الكروموسومات وتعريف الأعمدة الإضافية. قارن فترات وقيمًا ممثلة بالمصدر، بما فيها التقريب إلى الدقة الأحادية في bigWig وملخصات العرض.

الاختبار في بيئة المستلم

سلّم الملفات وإعدادات التحويل والمجاميع الاختبارية وإعدادات العرض. افتح المرجع والفترات نفسها في أداة المستلم. عند استخدام Track Hub، تحقّق أيضًا من ملفات الإعداد والاستضافة.

تنسيقات مقترحة

bigBed

مناسب لـ: نشر مسارات تعليقات مفهرسة

أقل ملاءمة لـ: معاملة الإشارات العددية المستمرة كعناصر تعليقات

bigWig

مناسب لـ: نشر إشارات عددية مرتبطة بفترات

أقل ملاءمة لـ: حفظ العلاقات الهرمية بين الجينات والنسخ دون تغيير

تحقق قبل التصدير

  • قد يتمكن من يعرف الرابط من الوصول إلى Hub غير مدرج. إخفاء الرابط ليس تحكمًا في الوصول؛ استخدم بيئة معتمدة للبيانات الحساسة.
  • احتفظ بالمصدر. تطابق العرض أو المجاميع لا يثبت صحة التحليل، وملخصات العرض ليست قيم الفترات الأصلية.

مقارنات ذات صلة

أدلة

المراجع والمواصفات