Guías
Cómo entregar anotaciones genómicas y pistas de señal
Separe las anotaciones de las señales numéricas y acuerde referencia, coordenadas, unidades y visor. Es un proceso distinto de conservar lecturas o alineamientos.
¿Qué formato deberías elegir?
Elige según la función de cada archivo en tu flujo de trabajo.
- Acordar significado y referencia
- Validar las copias de visualización
- Probar el entorno del destinatario
Acordar significado y referencia
Registre la versión del ensamblaje, los nombres de cromosomas y la convención de coordenadas. No confunda los intervalos de BED, de base cero y extremo final excluido, con otras convenciones. Documente unidades, normalización y valores ausentes frente a cero.
Validar las copias de visualización
Convierta anotaciones BED a bigBed o señales bedGraph a bigWig según corresponda. Revise orden, longitudes cromosómicas y columnas adicionales. Compare intervalos y valores representativos con el original, incluido el redondeo de precisión simple de bigWig y los resúmenes visuales.
Probar el entorno del destinatario
Entregue archivos, parámetros de conversión, sumas de comprobación y ajustes visuales. Abra la misma referencia e intervalos en el visor del destinatario. Si usa Track Hub, valide también configuración y alojamiento.
Formatos a considerar
Antes de exportar
- Un hub no listado puede ser accesible para quien conozca su URL. Ocultarla no controla el acceso; use un entorno autorizado para datos sensibles.
- Conserve los originales. La coincidencia visual o de sumas no demuestra la corrección del análisis; los resúmenes visuales no equivalen a los valores originales.